Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Prevalence and Molecular characterization of Carbapenem Resistant Enterobacteriaceae in Sohag University Hospital /
المؤلف
Farag, Radwa Mohammed.
هيئة الاعداد
باحث / رضوى محمد فرج
مشرف / هدير احمد المحلاوي
مشرف / حسناء احمد ابو الوفا
مشرف / ليلي محمد يوسف
مناقش / هبة الله جمال راشد
مناقش / محمد زكريا عبدالرحمن
الموضوع
Enterobacteriaceae Sohag.
تاريخ النشر
2020.
عدد الصفحات
140 P. :
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
أمراض الدم
تاريخ الإجازة
27/2/2020
مكان الإجازة
جامعة سوهاج - كلية الطب - الباثولوجيا الاكلينيكية والكيميائية
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 152

from 152

Abstract

يمثل تزايد انتشارمقاومة البكتيريا للمضادات الحيوية مشكلة صحية عامة خطيرة.فقد ارتبطت العدوى بهذه البكتيريا المقاومة للمضادات الحيوية بزيادة معدلالوفيات في جميع أنحاء العالم.إن البكتريا المعوية المقاومة للكاربابينيماصبحت تشكل خطرا على الصحة العامة ، وفي السنوات الأخيرة ، ازداد معدل الاصابةبالبكتريا المعوية المقاومة للكاربابينيمازديادا سريعا.
في البداية ، كانت البكتريا المعوية تشكل تهديدًا للصحة العامة نظرًا لقدرتها على مقاومة المضادات الحيوية عن طريق إنتاج اللاكتاميزات طويلة المدى. للتغلب على هذه المشكلة، إتجه المجتمع الطبي إلى استخدام أدوية مثل الكاربابينيم كخط اولفي العلاجات التجريبية. ولكن كان لهذا العلاج نتيجة غير متوقعة ، حيث انه أدى الى مشكلة أكثر خطورة ، وهي ظهور البكتريا المعوية المقاومة للكاربابينيم.
إن إنتاج انزيم Carbapenemase بالإضافة إلى آليات المقاومة الأخرى في البكتريا - مثل بيتا لاكتاماز - يجعل هذه الكائنات الدقيقة مقاومة لمعظم مضادات الميكروبات المتاحة.وهذا يؤدي الى انتشار الأوبئة وآلاف الوفيات الناتجة من استمرار العدوى على الرغم من العلاج.
تم الإبلاغ عن البكتريا المعوية المقاومة للكاربابينيم في جميع أنحاء العالم نتيجة اكتساب جينات Carbapenemase وقدم تم التعرف على اول جين(NmcA) منتج Carbapenemase في البكتريا المعوية في عام 1993ومنذ ذلك الحين تم التعرف على مجموعة كبيرة ومتنوعة من Carbapenemases في البكتريا المعوية.
هناك ثلاثمجموعات رئيسية من Carbapenemases:1) carbapenemaseالكلبسيلة الرئويةKPC)),2) فلزية بيتالاكتامازimipenemase[IMP])، فيرونا انتيجرون فلزية بيتا لاكتاماز [VIM]، نيو دلهي فلزية بيتا لاكتاماز[NDM]) .3)OXAcarbapenemases (OXA-48) .
هذه الأنزيمات متصلة ببعضها البعض نظراً لإتنشارها الواسع والسريع حيث إنه يتم ترجمتها من قبل الجينات الموجودة في العناصر الوراثية المتنقلة، مثل البلازميدات والترانسبوزونات. ويعد الانتقال الأفقي للجينات المقاومة الكاربابينيم بوساطة البلازميدات هو السبب الرئيسي في انتشار البكترية المعوية المقاومة للكاربابينم. ولذلك ، فإن الكشف الدقيق في الوقت المناسب للـبكتريا المعوية المقاومة للكاربابينم، وخاصة البكتريا المعوية المنتجة للانزيم المحلل للكاربابينيم ، مهم للغاية للوقاية والعلاج السريع لهذه العدوى.
تم تطوير مجموعة متنوعة من الطرق للكشف السريع عن الأنماط المظهرية والأنماط الجينية للبكتريا المعوية المقاومة للكاربابينم لاستخدامها في المختبرات وعلى الرغم من استخدامالاختبارات المظهرية على نطاق واسع في العديد من المختبرات فإنه من الضروري تأكيد إنتاج الانزيمات التي تمنح المقاومة للكاربابينيم عن طريق الإختبارات الجزيئية مثل تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) الذي يتميزبحساسية وخصوصيةعالية. إن الكشف عن وجود البكتريا المعوية المنتجة للانزيم المحلل للكاربابينم مهم للغاية للسيطرة على العدوى ومنع إنتشار هذا النوع من آلية المقاومة.
الهدف من الرسالة:
الهدف من هذه الرسالة هو تحديد معدل الانتشار والتنوع الجيني للبكتريا المعوية المقاومة للكاربابينيم في العينات التي تم تجميعها من المرضى المترددين على مستشفى سوهاج الجامعي.
تصميم الدراسة:
المرضى
تم تجميع عينات تحتوي على بكتريا معوية على مدار عام واحد من المرضى المحجوزين بمختلف الاقسام بمستشفى سوهاج الجامعىمن مختلف الفئات العمرية.
جميع هؤلاء المرضى خضعوا الى
1- تم جمع البيانات السريرية والوبائية للمرضى.
2- التحاليل المعملية:
• عزل وتحديد البكتريا السالبة لصبغة الجرام واختبار الحساسية لمضادات الميكروبات فى المختبر الرئيسي وذلك بالاستعانة بنظام فايتك-2 مع تسليط الضوء على مجموعة الكاربابينيم.
• التعرف على الجينات ودراسة الطفرات الجينية المقاومة للكاربابينيم,وتم جمع كل البيانات وجدولتها.
النتائج:
فيما يتعلق بعمروجنس مجموعة الدراسة،تراوح عمر المرضى من 6 شهور الى 83سنة و62٪ من العينة كانوا من الذكور.
وجدنا أن تشخيص المرضى الذين تمت دراستهم يختلف حيث تم توزيعهم على النحوالتالي: تم تشخيص 40.7٪ كـعدوى الاماكن جراحية، 28.7٪تم تشخيصهم على أنهم عدوى الجهازالتنفسي،6٪ تم تشخيصهم على أنهم عدوى الجهازالهضمي،5.3٪ تم تشخيصهم على أنهم امراض جلدية,2.7٪ لكل من العيوب الخلقية و الحمى مجهولة المصدر، 2 ٪ لكل من السكتة الدماغية والجفاف و8.9٪ للتشخيصات الأخرى.
تم جمع العينات من ثلاثة أقسام: قسم الجراحة (44٪),الأمراض الباطنة (28.7٪) وقسم الأطفال (27.3٪). وقد وجدنا أن مدة الاستشفاء تراوحت من يوم الى 61 يوم وبقيت معظم الحالات لدينا أكثرمن 10 أيام مع نسبة 58.7 ٪. ووجدنا أن الحالات المقاومة ظلت لفترة أطول بكثير.
وكانت أكثرمواقع الإصابة شيوعًا هي الجروح (31.3٪ من الحالات؛ 51.1٪ منها مقاومة) ؛والجهازالرئوي (23.3 ٪ ،مع 77 ٪ مقاومة). كان هناك فرق كبيربين المجموعتين الحساسه و المقاومة للكاربابينم فيما يتعلق بموقع الإصابة.
وجدنا في هذه الدراسة انواع مختلفة من العينات وهي: صديد بنسبة 33.3٪ ,بصاق بنسبة 21.3٪, بول بنسبة 21.3٪, دم بنسبة 16.7٪, براز بنسبة 4٪, سائل بللوري بنسبة 2٪و عينة سائل بريتوني واحدة و عينه سائل المخ و الحبل الشوكي.
فيمايتعلق بنوع الميكروب،وجدنا أن إي كولاي في 40.7٪ من حالات الدراسة، وكان 38.7٪ من ميكروب الكلبسيلا الرئوية، و13.3 ٪ من ميكروب إنتيروباكتر، ووزعت 7.3 ٪ بين ميكروبات أخرى و كانت أكثرالكلبسيلا الرئوية مقاومة للكاربابينم بنسبة77.6٪ .فيما يتعلق بالمضادات الحيوية، أظهرت نتائجنا أن 64.7 ٪ من حالات الدراسة كانت مقاومة للإرتابينيم؛ 58.7 ٪ لإيمبينيم؛ 57.3 ٪ إلى ميروبنيم وأيضا 57.3 ٪ إلى دوريبينيم.
و قد اظهر اختبار القرص المدمج اللذي تم اجراءه ان جميع العينات اجابيه لفلزيات بيتالاكتامز.
فيما يتعلق بوجود جين blaNDM، وجدنا أن33 ٪ من حالات الدراسة كانوا إيجابيين لجينblaNDM .فيما يتعلق بوجود جينblaOXA-48 ، وجدنا أن 16٪ من حالات الدراسةكانواإيجابيين لجينblaOXA-48 . وفيمايتعلق بوجود جينblaKPC ،وجدنا أن 6٪ من حالات الدراسة كانوا إيجابيين لجينblaKPC . وفيما يتعلق بوجود جينblaVIM ،وجدنا أن 1٪ من حالات الدراسة كانوا إيجابيين لجينblaVIM . ولم نجد اي حالة إيجابية لجين blaIMP. و لقد اظهرت النتائج التواجد المشترك لجينblaNDM و جين blaOXA-48 في اربع حالات.
تم عمل اختبار التسلسل الجيني ل 20 عينة اجابية للجين NDM bla و لقد وجدنا 4 متغيرات لهذا الجين و كان المتغير blaNDM-6 هو الاكثر انتشارا بنسبة 55 ٪.
وقد وجد أن معظم عينة الدراسة عاشت بنسبة 86.7٪،وكانت مقاومة المضادات الحيوية قد وصلت إلى 90 ٪ بين غيرالناجين،مع اختلاف إحصائي كبير.
الخلاصة والتوصيات:
• ان معدل انتشار البكتريا المعوية المقاومة للكاربابينم مرتفع في هذه الدراسة و كان الغالبية من الكلبسيلا الرئوية وكان جين blaNDM هو الاكثر انتشارا في هذه البكتريا.
• . يجب التحكم في استخدام المضادات الحيوية بشكل صارم من أجل تقليل انتشار البكتريا المعوية المقاومة للكاربابينم.
• يجب استخدام الاختبارات اللازمة لاكتشاف المقاومة للكاربابينم في البكتريا المعوية كروتين في مستشفى سوهاج الجامعي و جميع مراكز الخدمات الصحية في مصر.
• يجب اختبار فاعلية fosfomycintigecyclinecolistin كعلاج بديل لعلاج العدوى بالبكتريا المعوية المقاومه للكاربابينم.
• ان اختبار القرص المدمج يجب استخدامه كروتين ف معامل الميكروبايولوجي التي تقوم بعمل اختبارات الحساسية للمضادات الحيوية.
• ان الاختبارات الجينية مهمة للتعرف الدقيق علي الجينات المسئوله عن افراز الانزيمات المقاومة للكاربابينم.
• يجب استخدام اختبارات التسلسل الجيني لتتبع مصدر عدوى المستشفيات في جميع مرافق الخدمات الصحية.
• إن التنفيذ الناجح لبرنامج مكافحة العدوى أمر لا بد منه لحل مشكلة المقاومة البكتيرية ومنع انتشارها.
• يجب إجراء هذه الدراسة على عدد أكبر من الحالات في مراكز متعددة ، من أجل تقدير الانتشار الحقيقي للبكتريا المعوية المقاومة للكاربابينم في صعيد مصر.